Gnome 3.16にアップデートしたら、Trackball Emulationによるスクロールが効かなくなったので、その解決方法です。
原因は、Gnome 3.16からTrackball Emulationが可能になったため。
残念なことに、Gnome側から制御する方法がわからない（何より調べるのが面倒）ので、Gnomeによるマウス管理をオフにすることで解決しました。
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.mouse active false
これでOKです。Guiなら、dconf-editorを使っても良いでしょう。
ちなみに、Linux環境でTrackballのスクロールを可能にする方法は、こちら。
要するに、/usr/share/X11/xorg.conf.d/10-evdev.conf に、下記を追記すれば使えるようになります（設定ファイルはディストリによって多少違いますが）。
Section "InputClass"
Identifier "Marble Mouse"
MatchProduct "Logitech USB Trackball"
Option "EmulateWheel" "true"
Option "EmulateWheelButton" "8"
Option "XAxisMapping" "6 7"
Option "Emulate3Buttons" "true"
EndSection
ちなみに使っているマウスは、こちら。
トラックボールは動かす範囲が少ないので、肩にやさしい気がします。
狭い机の上でも使えるというメリットもあります。
私のまわりでは、使っている人をほとんど見ないのですが、肩こりや机周りの掃除で悩む人にはオススメです。
